二級建造師證書不注冊不會作廢，但是二級建造師不注冊是不能以二級建造師名義執業的。一級建造師證書注冊有效期為3年，根據《注冊建造師管理規定》，取得建造師執業資格證書的人員，必須經過注冊登記，方可以建造師名義執業，此規定還提到了二級建造師初始注冊所需要的條件。
二級建造師初始注冊條件1. 經考核認定或考試合格取得資格證書；
2. 受聘于一個相關單位；
3. 達到繼續教育要求。
所需資料：
注冊建造師初始注冊申請表；
資格證書、學歷證書和身份證明復印件；
申請人與聘用單位簽訂的聘用勞動合同復印件或其他有效證明文件；
逾期申請初始注冊的，應但提供達到繼續教育要求的證明材料。
二級建造師注冊流程1、上“二級建造師注冊管理系統”個人版，點“注冊”并輸入信息，記住密碼；
2、通過密碼登陸系統，在出現的版塊里填個人真實資料；最好填寫兩個自己參與過的工程信息；
3、提交；
4、插入你準備注冊的企業密碼鎖登陸“二級建造師注冊管理系統”企業版，點擊同意并上報；
5、打印帶條形碼的表格并蓋章簽字，上交主管部門。
6、用檔案袋裝如下紙質材料上交到主管部門：申請表、企業資質復印件、執業資格證書復印件、畢業證書復印件、身份證復印件、合同復印件、照片
以上完善并完成注冊，注冊審查時間到發證一般為半年。證件時間過期之后的二級建造師注冊流程不需要按照以上流程，只需要再進行核對并考試合格就可以。
